Директива disable_functions используется для отключения не нужных функций. С ее помощью можно отключить такие функции как shell_exec и phpinfo, на которые в первую очередь и нацелены злоумышленники при первичном анализе сайта. Для защиты Ваших сайтов на виртуальном хостинге по умолчанию отключены следующие функции PHP:

exec, passthru, system, shell_exec, popen, proc_open, pcntl_exec, putenv, link, symlink